A Bíblia não foi escrita como um livro científico, mas com uma abordagem fenomenológica. Ela descreve os fenômenos físicos somente em sua aparência e não como realmente são. Por exemplo, ela diz que o sol "surge", embora saibamos cientificamente que é a rotação da Terra ao redor do sol que nos dá essa impressão. Porém, do ponto de vista humano, o sol de fato surge. E é desse modo que a Bíblia registra o fenômeno. O objetivo da Bíblia não é ensinar ciência, mas comunicar verdades espirituais. É com essa visão que ela deve ser lida.

Mesmo assim, quando a Bíblia se refere a fenômenos científicos, é extremamente precisa. Em Amós 5:8 e Jó 36:27, o ciclo de evaporação e precipitação da água é acuradamente descrito. De Gênesis a Deuteronômio, muitos princípios médicos são incluídos entre as leis higiénicas dos israelitas – princípios que só passaram a ser compreendidos nos últimos 100 anos! A circuncisão, por exemplo (Gênesis 17:10), reduz o risco de câncer no pênis, e o fator de coagulação do sangue é maior no oitavo dia do que no sétimo e, curiosamente, no nono (Gênesis 17:12)! Princípios genéticos podem explicar o experimento de Jacó com as crias de Labão em Gênesis 30:37-43. O livro de Gênesis contém outras suposições científicas que têm sido comprovadas pela ciência moderna. Alguns exemplos:

A precisão da Bíblia em questões científicas é impressionante quando comparada a outros livros como o Qur'an, que afirma que o sol e as estrelas se movem ao redor da Terra (21:33), que pedaços do céu caem, com consequência fatal e que estrelas armadas protegem as galáxias de espíritos maus.

Obviamente, os milagres descritos na Bíblia violam as leis "científicas", como nós as entendemos. E é por isso mesmo que são chamados de milagres! No entanto, um sistema científico fechado, que não permite qualquer evento que não possa ser explicado por suas próprias leis, é um sistema incompleto. Por exemplo, a física Newtoniana oferece detalhadas explicações sobre grandes objetos que se movem a velocidades baixas, mas não é válida para corpos pequenos movimentado-se a altas velocidades, que fazem parte dos domínios da mecânica quântica e da relatividade. Dizer que Deus, o criador das leis físicas, não pode decidir sobre essas leis, é uma atitude arrogante que vai contra o cerne da história da ciência. Descobertas científicas sempre proporcionam o entendimento de fatos ou situações anteriormente não compreendidos. Dessa forma, o "milagre" de ontem é a tecnologia de hoje (satélites, aviões, internet, telefones, etc).

Um ponto do Antigo Testamento que parece ir contra a ciência moderna é a incrível longevidade das pessoas antes do dilúvio (Gênesis 1-5), pois para alguns casos a vida durava quase um milénio! Entretanto, pode-se argumentar que as condições da Terra para uma vida longa eram ideais naquela época, com o virtual desconhecimento de doenças, e um mundo perfeito em estado não degradado. É perfeitamente possível que o pecado e as preocupações do homem afetaram sua composição genética e, assim, sua longevidade, e que o dilúvio tenha introduzido enormes mudanças ecológicas que reduziram grandemente a expectativa de vida do homem. Avanços da medicina moderna ainda não permitiram a compreensão de muitos dos segredos da vida; talvez, em alguns séculos, as idades "bíblicas" voltem a ser comuns, e as pessoas não mais duvidarão dos registros da Bíblia sobre isso.

Charles Darwin popularizou a teoria da evolução propondo um mecanismo segundo o qual a natureza escolheria espécimes superiores mutantes para sobreviver em maior número que os demais e, então, esses espalhariam sua herança genética e uma nova e modificada espécie surgiria. Apesar de haver muitas evidências de que os organismos se adaptam ao seu meio ambiente e mudam ao longo do tempo, praticamente não há evidências de que seres unicelulares se desenvolveram por meio da seleção natural até alcançarem as formas complexas de vida que hoje conhecemos. De fato, ao resumir a polêmica ao redor da teoria de Darwin, D. J. Tice (Ambassador magazine, outubro de 1996) observou: "O registro fóssil não mostra uma mudança gradual e constante nos organismos; mostra espécies que permaneceram quase exatamente as mesmas ao longo de suas existências, geralmente ao longo de milhões de anos, e mostra novas formas de características muito distintas – óvulos, fetos, baleias e golfinhos, insetos, plantas que dão flores e muitas outras – aparecendo subitamente, totalmente constituídas, com poucas e preciosas 'formas de transição' que possam sugerir o tipo de desenvolvimento lento e constante que o darwinismo prevê."